Un grand nombre d'animaux nuisibles peuvent être contrôlés en protégeant leurs ennemis naturels et en éliminant leurs plantes hôtes.
Les coccinelles et les syrphes sont des ennemis bien connus des pucerons, et les guêpes parasites tuent de nombreuses chenilles d'insectes nuisibles, en y pondant leurs œufs et les larves qui en sortent se nourrissent des chenilles. Les oiseaux sont aussi des aides indispensables dans le jardin. Par conséquent, une attention particulière doit être accordée à la protection des oiseaux, u.a. en fournissant des sites de nidification appropriés. Cependant, ceux-ci ont besoin d'une protection spéciale contre les chats et autres prédateurs d'oiseaux.