Wiele szkodników zwierzęcych można kontrolować, chroniąc ich naturalnych wrogów i eliminując rośliny żywicielskie.
Biedronki i bzygi są dobrze znanymi wrogami mszyc, a pasożytnicze osy zabijają liczne gąsienice owadzich szkodników, składając w nim jaja, a wylęgające się z nich larwy żywią się gąsienicami. Ptaki są również niezbędnymi pomocnikami w ogrodzie. Dlatego szczególną uwagę należy zwrócić na ochronę ptaków, u.a. poprzez zapewnienie odpowiednich miejsc lęgowych. Wymagają one jednak specjalnej ochrony przed kotami i innymi drapieżnikami ptaków.